Mulder und Scully kehren nach Bellefleur in Oregon zurück, wo sie vor sieben Jahren ihren ersten gemeinsamen Fall bearbeiteten. Dort sind zahlreiche Menschen verschwunden. Offenbar wurden sie von Außerirdischen entführt.
Als ein britisches und ein sowjetisches U-Boot spurlos verschwinden, wird Super-Agent James Bond zusammen mit seiner hübschen russischen Kollegin Anya Amasova auf den mysteriösen Fall angesetzt. Gemeinsam sollen sie die bösen Pläne von Bonds Erzfeind, dem größenwahnsinnigen Bösewicht Karl Stromberg, durchkreuzen, der die Welt mit Atombomben, die auf Moskau und New York City gerichtet sind,... James Bond 007 - Der Spion, der mich liebte